Добрый вечер!
На всякий случай, настоятельно рекомендую вам обновиться. Сейчас актуальным является релиз 2.0.38.6. В него попало достаточно много существенных изменений, в частности по СФ-рам при посреднических операциях. В вашем релизе просто невозможно отразить часть операций по НДС в соответствии с законодательством.
Давайте сначала про отражение корректировок в программе 1С.Бух. 8.2.
1. Независимо от того, в сторону увеличения или в сторону уменьшения вам предоставлен входящий корректировочный счет-фактура, в пр-ме нужно начинать отражение корректировки путем создания док-та "Корректировка поступления" вводом на основании из первоначального док-та "Поступление товаров и услуг". (Это вы сделали). Если корректируются расчеты с поставщиком товаров, услуг, а они в вашем случае корректируются, то флажок в верхней правой части экранной формы документа должен быть установлен в позиции "НДС, бухгалтерский и налоговый учет". Если согласно предоставленому корр.документу поставщика изменилась налоговая база для НДС, то следует выбирать вариант вида операции - вариант отражения "Корректировка по согласованию сторон".
При уменьшении стоимости покупки согласно корр.документу под табличной частью следует проставить галочку на варианте "Восстановить НДС в книге продаж".
При увеличении стоимости покупки согласно корректировочного документа под табличной частью следует галочку на упомянутом варианте устанавливать нет нужды.
Документ "Корректировка поступления" нужно провести, можно проверить создавшиеся регистры в результате провдения (кн. Дт/Кт).
2. Прямо из созданного документа "Корректировка поступления" по гиперссылке внизу экранной формы "Ввести счет-фактуру" вы создаете новый документ. В верхнем правом поле "Вх.номер и дата" вносите реквизиты предоставленного вам СФ-ры. Заметьте, что предыдущий СФ-ра к первоначальному поступлению услуги (к первичной покупке) у вас должен сразу автоматически проставится в соответ.поле - "к счету-фактуре номер". Кроме того, вы можете отредактировать остальные реквизиты из вход.корр.документа, при необходимости. В разделе "Получение счета-фактуры" заполнить информацию для Журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур:
в поле "Код вида операции" – значение 01 (или иное), как и в корректируемом счете-фактуре;
уточнить способ получения корректировочного счета-фактуры, по умолчанию - "На бумажном носителе".
При проведении документ вносит в регистр сведений "Журнал учета счетов-фактур" запись для Журнала учета полученных и выставленных счетов-фактур.
---
Теперь насчет сдачи уточненных деклараций по НДС. Если налоговая база изменялась в сторону уменьшения, то есть если получилось так, что вы как бы за прошлый период не доначислили и не доплатитли НДС, то уточненные декларации сдать нужно.
Приведу цитату из комментариев специалистов-экспретов, пишущих статьи на дисках ИТС, для пользователей программ 1С.
Цитата:С 1 октября 2011 года порядок корректировки налоговой базы для таких случаев закреплен в гл. 21 Налогового кодекса РФ. При этом механизм внесения уточнений зависит от того, увеличилась стоимость или уменьшилась. Заметим, что и в том и в другом случае продавец должен уведомить покупателя об изменении стоимости отгруженных товаров, выполненных работ, оказанных услуг, переданных имущественных прав. Для этого стороны могут заключить соответствующее соглашение или договор. В то же время согласие покупателя или факт уведомления его об изменении стоимости может подтвердить любой первичный документ (например, накладная или акт с новой ценой).Если стоимость после отгрузки увеличиласьЕсли стоимость товаров (работ, услуг, имущественных прав) после их отгрузки увеличивается, то продавец увеличивает налоговую базу периода отгрузки (п. 10 ст. 154 НК РФ). Когда отгрузка и повышение стоимости приходятся на разные кварталы, продавец подает уточненную декларацию за период отгрузки и уплачивает доначисленный налог. При этом он выставляет покупателю корректировочный счет-фактуру. Такой счет-фактура выставляется не позднее пяти календарных дней со дня составления документа, подтверждающего согласие (факт уведомления) покупателя на изменение стоимости (п. 3 ст. 168, п. 10 ст. 172 НК РФ). Подробнее см.рубрику "Корректировочный счет-фактура".На основании такого корректировочного счета-фактуры покупатель сможет принять к вычету разницу между суммами НДС, исчисленными до и после увеличения стоимости (подробнее см. рубрику "Вычет НДС по корректировочному счету-фактуре").Если стоимость после отгрузки уменьшиласьЕсли стоимость товаров уменьшается, продавец также обязан выставить корректировочный счет-фактуру покупателю на разницу в стоимости (п. 3 ст. 168 НК РФ). При этом продавец не уменьшает налоговую базу периода отгрузки, а на основании выставленного корректировочного счета-фактуры разницу между суммами налога по первоначальному счету-фактуре и суммой налога после уменьшения стоимости принимает к вычету. Применяя вычет, продавец "возвращает" себе часть налога, уплаченного с первоначальной стоимости отгрузки, которая не учитывала изменение. Этим вычетом он может воспользоваться в течение трех лет при наличии документов об изменении стоимости (п. 13 ст. 171, п. 10 ст. 172 НК РФ). Подробнее см. рубрику "Вычет НДС по корректировочному счету-фактуре".Покупатель корректирует свои налоговые обязательства, восстанавливая налог в периоде, в котором произошло наиболее раннее событие: получены первичные документы на уменьшение стоимости или получен корректировочный счет-фактура (пп. 4 п. 3 ст. 170 НК РФ).До 1 октября 2011 года Налоговый кодекс РФ не содержал положений о том, как корректировать налоговые обязательства по НДС при изменении стоимости после отгрузки. Чиновники были убеждены, что в этом случае следует уточнять налоговую базу того периода, когда товар был реализован. Поэтому если отгрузка осуществлялась в одном квартале, а цена изменялась в следующем, во избежание споров с проверяющими налогоплательщики представляли уточненные декларации по НДС (см. письма Минфина РФ от 13 ноября 2010 г. № 03-07-11/436, от 25.10.2007 № 03-07-11/524, от 26.07.2007 № 03-07-15/112). Тем, кто, вопреки мнению чиновников, корректировал налоговую базу за тот период, в котором стоимость изменилась, приходилось отстаивать свою правоту в суде.Кроме того, при уменьшении цены продавец был вынужден вносить исправления в отгрузочные счета-фактуры. По причине трудоемкости такого процесса практиковалось составление "отрицательных" счетов-фактур. Однако чиновники выступали против такого порядка, ссылаясь на то, что составление "отрицательных" счетов-фактур Налоговым кодексом РФ не предусмотрено (см. письма Минфина РФ от 02.08.2010 № 03-07-09/41, от 23.04.2010 № 03-07-11/138, от 03.11.2009 № 03-07-09/55). Право на выставление счета-фактуры с отрицательными показателями можно было отстоять в суде.
В комментарии предложены варианты того, как поступать в части уточнения своих обязательств по НДС каждой из сторон сделки (и продавцу, и покупателю). В вашем случае, понятно, что вы - покупатель.